乱太郎（らんたろう）たちとくノ一三人組は、そうじを手伝ったごほうびに食堂のおばちゃんからおまんじゅうをもらう。おまんじゅうの最後の三つをめぐって、乱太郎たちとくノ一たちは、『忍術かくれんぼ』で勝負し、勝った組が食べることに決める。

乱太郎（らんたろう）たちのところへ、中間テストの課題が「戦輪（せんりん）」になったことを聞きつけた滝夜叉丸（たきやしゃまる）先輩がやって来る。一年は組の忍たまたちに、得意の「戦輪」を指導するから校庭に来るようにというのだが・・・。

申し出を無視された滝夜叉丸（たきやしゃまる）は、「意地でも善意の特訓をしてやる。」と夜中、一年は組の宿舎に押しかける。逃げ遅れた乱太郎（らんたろう）、きり丸、しんべヱは、結局、滝夜叉丸から「戦輪」の個人指導を受けることになるのだが・・・。

知らずに忍術禁止区域で「戦輪（せんりん）」を使ってしまった乱太郎（らんたろう）たち。キノコ協同組合の副組合長との約束で、学園長はヨーカンを届けることに。乱太郎たちはヨーカンを届け、人質になっていた滝夜叉丸（たきやしゃまる）を連れ戻そうとするが・・・。

しんべヱのパパさんからしんべヱあてにカステラが届く。そのカステラが気になってしかたがない学園長は、同封の手紙にあった「みなさんで召し上がれ。」という言葉どおり、しんべヱがカステラのおすそ分けをしてくれると信じて待っていたのだが・・・。