早朝ランニング中に「忍術学園まで案内して欲しい。」と知らないおじさんに呼び止められた乱太郎（らんたろう）、きり丸、しんべヱ。さっそく案内することに・・・。ところがふつうのおじさんは世を忍ぶ仮の姿で、その正体は超一流の忍者らしいのだ。

２０年来のうらみを晴らしに忍術学園にやってきたおじさん。ところがその相手の名前がわからない。手がかりは、鋭い目つきの持ち主で忍術学園にいる。ということだけなのだ。乱太郎（らんたろう）たちに協力してもらい探しだそうとしたのだが・・・。

超一流の忍者だと思っているおじさんが、うらみを晴らす相手は山田（やまだ）先生だった。山田先生に決闘を申し込んだおじさん。ところがとことんツキのないおじさんは、練習でも失敗ばかり。しかし、プライドは超一流の忍者なのだ。